Simon ARRAGAIN

Après des études à l’université Grenoble-Alpes, j’ai réalisé ma thèse au CEA de Grenoble (UMR 5249, UGA/CNRS/CEA), sous la direction du professeur Marc Fontecave et du Dr. Hamid Atta, sur des métalloprotéines (MiaB, MtaB, RimO) à centres [FeS] appelées Radical SAM qui catalysent des réactions de thiométhylation sur des ARN de transfert ou sur la protéine ribosomale S12. Ces travaux ont montré que ces enzymes ne sont pas des enzymes « suicides » (comme présentées dans la littérature) mais qu’en présence de sulfure, elles sont capables d’insérer du soufre sans dégrader leur centre [FeS]. J’ai effectué ensuite un premier post-doctorat à Universidad Politécnica de Madrid (2011-2014) sur une autre enzyme radical SAM appelée NifB sous la direction du professeur Luis Rubio. Ces travaux ont démontré que l’enzyme NifB possède trois centres [4Fe-4S] indispensables pour synthétiser le cofacteur NifB-co qui est le précurseur essentiel pour la biosynthèse du FeFe-co, FeV-co et FeMo-co des nitrogenases à fer, à vanadium et à molybdène. En octobre 2014, j’ai été nommé maitre de conférence associé au Collège de France dans la chaire de Chimie des Processus Biologiques (UMR 8229) dirigée par le professeur Marc Fontecave. Pendant deux ans, j’ai travaillé sur des métalloprotéines à centre [FeS] l’une possédant un centre [4Fe-4S] est impliquée dans la thiolation d’ARN de transfert et l’autre est une diacylglycerol acyltransferases qui possède un centre [2Fe-2S]. J’ai ensuite travaillé comme Research Project Scientist (2017-2018) à l’Université de Davis en Californie dans le laboratoire du Professeur Stephen Cramer sur les hydrogénases [Fe-Fe] et sur les nitrogénases. En parallèle, j’ai travaillé à l’Université de Stanford dans le laboratoire du Professeur James Swartz sur la biosynthèse du cluster H des hydrogénases [Fe-Fe] (2017-2018).

Depuis novembre 2018, je conduis des travaux de recherche dans le département Biotechnologie d’IFPEN, pour travailler sur des enzymes, les cellulases, produites par le champignon T. reesei, qui sont utilisées pour dégrader la biomasse ligno-cellulosique. La dégradation optimale de la biomasse ligno-cellulosique est une des voies pour développer une bioéconomie basée sur une ressource abondante (biomasse) et renouvelable. 

17 articles publiés dans des revues à comité de lecture

H= 12

3 conférences dans des congrès internationaux dont 1 conférence invité (Gordon conference, Carbohydrate-Active Enzymes for Glycan Conversions, 2019), 2 séminaires invités, 1 conférence dans un congrès national.

Activité comme reviewer pour Biotechnology for Biofuels